Nužudytų Lietuvos žydų skaičiai gana prieštaringi. Nelabai aiškūs ir Lietuvoje nužudytų užsienio žydų skaičiai.

Holokausto skaičių įvairovę ir prieštaringumą rodo tokie pavyzdžiai: Ypatingosios valstybinės komisijos pranešime užfiksuota, kad Vilniaus apskr. Plikojo kalno dauboje sušaudyta 10 000 žmonių¹¹ (manytina, kad dauguma nužudytųjų – tai Vilniaus apskr. žydai iš Naujosios Vilnios, Mickūnų, Lavoriškių, Šumsko, Medininkų, Totorkaimio ir kt. vietovių). Toks pat skaičius minimas ir kaltinamojoje išvadoje¹². Tik čia kapų vietovė pavadinta Lapių kalneliu. O Vilniaus žydų bendruomenė 1945 05 23 rašte Ypatingajai valstybinei komisijai nurodė, kad Plikajame kalne nužudyta 55 000 žydų¹³. Beje, tame rašte taip pat nurodyta, kad iš 65 000 Vilniaus žydų išžudyta 63 000.

Šiaip jau gana kruopštūs autoriai Kazys Rukšėnas ir Vladislovas Sinkevičius didelėje, bet lietuvių istorikų mažai naudojamoje studijoje apie žmonių naikinimą Lietuvoje vokiečių okupacijos metais pažymi, kad 1941 08 26 Pažemio miške buvo sušaudyti visi Zarasų apskrities žydai – 8 000 žmonių¹⁴. Masinių žudynių dokumentų rinkinio priede užfiksuota, kad minėtą dieną Pažemio miške sušaudyti 2 569 žmonės¹⁵. Beje, tuose kapuose stovi sovietmečiu pastatytas paminklas, kuriame atminimo įrašas yra ir žydų kalba. Tai labai retas faktas sovietmečiu. Kazys Rukšėnas ir Vladislovas Sinkevičius mini, kad 1941 09 09 Klydžionių kaime prie Butrimonių sušaudyti 1 232 žydai (976 vyrai ir moterys, 256 vaikai)¹⁶. Minėto dokumentų rinkinio priede pažymėta, kad 1941 09 09 Klydžionių kaime sušaudyta 740 vyrų, moterų ir vaikų¹⁷. O Jeruzalėje išleistoje dokumentinėje apybraižoje yra dviejų paminklų Butrimonių apylinkėse (matyt, Klydžionių kaime) sušaudytiems Butrimonių, Stakliškių, Birštono, Punios žydams nuotraukos. Vienas paminklas žymi 265, o kitas – 976 aukas¹⁸ (viso 1 241). Itin prieštaringi duomenys apie Telšių apskrities Gerulių miško aukas: šių dokumentų rinkinio priede įrašyta 1 580 sušaudytų vyrų, moterų ir vaikų¹⁹, o Kazys Rukšėnas ir Vladislovas Sinkevičius mini ten sušaudytus 10 000 žmonių.²⁰ Panašių prieštarų yra ir daugiau.

Kiek apskritai buvo sunaikinta Lietuvos žydų? Čia informacija irgi nevienoda. Aleksis Faitelsonas mini, kad Lietuvoje išžudyta 80% žydų iš